MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Carnobacterium sp. 17-4 plasmid pCAR50

Total Repeats: 405

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_015390	AGT	2	6	42	47	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2	NC_015390	CA	3	6	1497	1502	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
3	NC_015390	AGG	2	6	1554	1559	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4	NC_015390	T	6	6	2295	2300	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_015390	TTC	2	6	2309	2314	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6	NC_015390	T	7	7	2317	2323	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_015390	T	7	7	2365	2371	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_015390	GT	3	6	2373	2378	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
9	NC_015390	ACA	2	6	2466	2471	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10	NC_015390	ATA	2	6	2546	2551	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NC_015390	TTTAT	2	10	2588	2597	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_015390	TA	3	6	2608	2613	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NC_015390	AGA	2	6	2616	2621	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
14	NC_015390	T	9	9	3275	3283	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
15	NC_015390	TTAA	2	8	3292	3299	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
16	NC_015390	T	7	7	3305	3311	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_015390	GTTG	2	8	3336	3343	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
18	NC_015390	T	8	8	3348	3355	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_015390	GT	3	6	3395	3400	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
20	NC_015390	TTATT	2	10	3418	3427	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NC_015390	AAT	2	6	3438	3443	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NC_015390	GAA	2	6	3459	3464	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
23	NC_015390	TCTTA	2	10	3469	3478	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
24	NC_015390	ATA	2	6	3482	3487	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
25	NC_015390	AGG	2	6	3579	3584	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
26	NC_015390	TAA	2	6	5454	5459	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
27	NC_015390	AGG	2	6	6351	6356	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
28	NC_015390	TAT	2	6	8289	8294	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
29	NC_015390	AGA	3	9	8315	8323	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
30	NC_015390	GTA	2	6	8396	8401	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
31	NC_015390	TTA	2	6	8402	8407	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
32	NC_015390	GAA	2	6	8412	8417	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
33	NC_015390	TAA	2	6	8424	8429	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
34	NC_015390	TAC	2	6	8430	8435	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
35	NC_015390	T	11	11	8493	8503	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
36	NC_015390	A	7	7	8514	8520	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
37	NC_015390	A	8	8	8523	8530	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
38	NC_015390	TAAA	2	8	8531	8538	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
39	NC_015390	TAA	2	6	8555	8560	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
40	NC_015390	CATT	2	8	8607	8614	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
41	NC_015390	GAT	2	6	8629	8634	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
42	NC_015390	CTTT	2	8	8636	8643	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
43	NC_015390	A	6	6	8666	8671	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
44	NC_015390	AC	3	6	8758	8763	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
45	NC_015390	TAAA	2	8	8953	8960	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
46	NC_015390	AAATA	3	15	8961	8975	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
47	NC_015390	TTA	2	6	9000	9005	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
48	NC_015390	TGA	2	6	9009	9014	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
49	NC_015390	AG	3	6	9017	9022	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
50	NC_015390	AGGA	2	8	10505	10512	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
51	NC_015390	AAAC	2	8	13399	13406	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
52	NC_015390	TAAAA	2	10	13407	13416	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
53	NC_015390	TG	3	6	13487	13492	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
54	NC_015390	ATAA	2	8	13498	13505	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
55	NC_015390	AGA	2	6	13515	13520	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
56	NC_015390	A	7	7	14438	14444	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
57	NC_015390	T	6	6	14459	14464	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
58	NC_015390	CTA	2	6	14521	14526	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
59	NC_015390	T	7	7	14527	14533	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
60	NC_015390	T	6	6	14584	14589	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
61	NC_015390	A	7	7	14691	14697	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
62	NC_015390	TCTT	2	8	14700	14707	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
63	NC_015390	AAG	2	6	14741	14746	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
64	NC_015390	TAA	2	6	14785	14790	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
65	NC_015390	CAT	2	6	14797	14802	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
66	NC_015390	ATT	2	6	14836	14841	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
67	NC_015390	GCT	2	6	14915	14920	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
68	NC_015390	TAAA	2	8	14931	14938	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
69	NC_015390	AAT	2	6	15002	15007	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
70	NC_015390	AGG	2	6	15042	15047	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
71	NC_015390	TAA	2	6	15063	15068	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
72	NC_015390	TAAA	2	8	15117	15124	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
73	NC_015390	TAAC	2	8	15141	15148	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
74	NC_015390	TTC	2	6	15214	15219	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
75	NC_015390	ATTT	2	8	15230	15237	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
76	NC_015390	TAAA	2	8	15280	15287	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
77	NC_015390	A	9	9	15285	15293	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
78	NC_015390	A	6	6	15306	15311	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
79	NC_015390	TA	3	6	15342	15347	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
80	NC_015390	TCC	2	6	17646	17651	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
81	NC_015390	T	7	7	19571	19577	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
82	NC_015390	TAC	2	6	19601	19606	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
83	NC_015390	AGG	2	6	19663	19668	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
84	NC_015390	TAAC	2	8	19679	19686	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
85	NC_015390	TCA	2	6	19721	19726	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
86	NC_015390	TA	3	6	19761	19766	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
87	NC_015390	AGA	2	6	19769	19774	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
88	NC_015390	TAAT	2	8	19780	19787	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
89	NC_015390	TAT	2	6	19815	19820	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
90	NC_015390	ATT	2	6	19870	19875	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
91	NC_015390	AAT	2	6	19917	19922	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
92	NC_015390	TAA	2	6	20016	20021	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
93	NC_015390	TAGT	2	8	20024	20031	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
94	NC_015390	TTTA	2	8	20077	20084	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
95	NC_015390	A	8	8	20198	20205	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
96	NC_015390	GTT	2	6	20258	20263	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
97	NC_015390	AAT	2	6	20266	20271	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
98	NC_015390	TA	3	6	20289	20294	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
99	NC_015390	AT	4	8	20314	20321	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
100	NC_015390	A	6	6	20335	20340	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
101	NC_015390	T	7	7	20916	20922	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
102	NC_015390	GAT	2	6	20927	20932	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
103	NC_015390	AGA	2	6	20969	20974	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
104	NC_015390	ATTT	2	8	20981	20988	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
105	NC_015390	AT	3	6	20999	21004	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
106	NC_015390	ATT	2	6	21033	21038	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
107	NC_015390	TAT	2	6	21080	21085	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
108	NC_015390	CGA	2	6	21086	21091	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
109	NC_015390	AACA	2	8	21203	21210	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
110	NC_015390	GAT	2	6	21243	21248	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
111	NC_015390	A	6	6	21323	21328	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
112	NC_015390	TCG	2	6	21359	21364	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
113	NC_015390	AAT	2	6	21385	21390	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
114	NC_015390	TAC	2	6	21535	21540	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
115	NC_015390	TA	4	8	21582	21589	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
116	NC_015390	A	8	8	21599	21606	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
117	NC_015390	TTTG	2	8	21659	21666	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
118	NC_015390	TG	3	6	21665	21670	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
119	NC_015390	GT	3	6	21678	21683	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
120	NC_015390	T	6	6	21770	21775	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
121	NC_015390	TGA	2	6	21800	21805	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
122	NC_015390	TAA	2	6	21878	21883	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
123	NC_015390	T	6	6	21893	21898	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
124	NC_015390	GTG	2	6	21905	21910	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
125	NC_015390	TACA	2	8	21934	21941	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
126	NC_015390	GAT	2	6	21944	21949	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
127	NC_015390	CGA	2	6	21973	21978	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
128	NC_015390	GAA	2	6	21997	22002	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
129	NC_015390	GAT	2	6	22115	22120	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
130	NC_015390	GTCT	2	8	22140	22147	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
131	NC_015390	AG	3	6	22151	22156	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
132	NC_015390	AC	3	6	22177	22182	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
133	NC_015390	GTC	2	6	22185	22190	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
134	NC_015390	AAGAAA	2	12	22715	22726	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
135	NC_015390	A	7	7	22782	22788	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
136	NC_015390	AGA	2	6	22857	22862	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
137	NC_015390	TGATCT	2	12	22888	22899	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
138	NC_015390	CAT	2	6	22936	22941	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
139	NC_015390	GAA	2	6	22961	22966	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
140	NC_015390	TCT	2	6	23168	23173	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
141	NC_015390	GAC	2	6	23373	23378	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
142	NC_015390	ATT	2	6	23430	23435	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
143	NC_015390	TAG	2	6	23469	23474	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
144	NC_015390	AATT	2	8	23509	23516	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
145	NC_015390	T	6	6	23575	23580	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
146	NC_015390	GTTC	2	8	23588	23595	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
147	NC_015390	T	6	6	23621	23626	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
148	NC_015390	A	7	7	23709	23715	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
149	NC_015390	ATT	2	6	23787	23792	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
150	NC_015390	GAC	2	6	23911	23916	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
151	NC_015390	TAC	2	6	23971	23976	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
152	NC_015390	ACAG	2	8	23999	24006	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
153	NC_015390	TTAT	2	8	24007	24014	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
154	NC_015390	CAT	2	6	24020	24025	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
155	NC_015390	ACAG	2	8	24031	24038	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
156	NC_015390	TAC	2	6	24055	24060	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
157	NC_015390	TAAA	2	8	24104	24111	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
158	NC_015390	TAA	2	6	24150	24155	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
159	NC_015390	TAC	2	6	24180	24185	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
160	NC_015390	TAAA	2	8	24188	24195	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
161	NC_015390	CAAC	2	8	24206	24213	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
162	NC_015390	TA	3	6	24246	24251	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
163	NC_015390	TAGA	2	8	24296	24303	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
164	NC_015390	AGC	2	6	24310	24315	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
165	NC_015390	AAG	2	6	24387	24392	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
166	NC_015390	A	8	8	24403	24410	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
167	NC_015390	GAG	2	6	24411	24416	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
168	NC_015390	A	8	8	25203	25210	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
169	NC_015390	TGCA	2	8	25227	25234	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
170	NC_015390	GAAA	2	8	25277	25284	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
171	NC_015390	CCTTT	2	10	25299	25308	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
172	NC_015390	AATT	2	8	25328	25335	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
173	NC_015390	T	6	6	25349	25354	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
174	NC_015390	TCTTTA	2	12	25373	25384	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
175	NC_015390	T	7	7	25441	25447	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
176	NC_015390	A	6	6	25465	25470	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
177	NC_015390	AAT	2	6	25486	25491	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
178	NC_015390	AT	3	6	25509	25514	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
179	NC_015390	TTAT	2	8	25529	25536	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
180	NC_015390	TA	3	6	25539	25544	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
181	NC_015390	TAA	2	6	25546	25551	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
182	NC_015390	TAT	2	6	25557	25562	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
183	NC_015390	T	8	8	25568	25575	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
184	NC_015390	GTC	2	6	25606	25611	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
185	NC_015390	TATT	2	8	25676	25683	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
186	NC_015390	ACT	2	6	25719	25724	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
187	NC_015390	CAA	2	6	25741	25746	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
188	NC_015390	TAAT	2	8	25853	25860	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
189	NC_015390	ATA	2	6	25885	25890	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
190	NC_015390	T	6	6	25901	25906	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
191	NC_015390	A	7	7	25977	25983	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
192	NC_015390	T	6	6	26517	26522	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
193	NC_015390	ATC	2	6	26528	26533	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
194	NC_015390	ATA	2	6	26579	26584	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
195	NC_015390	TAATT	2	10	26664	26673	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
196	NC_015390	TA	3	6	26689	26694	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
197	NC_015390	AT	4	8	27832	27839	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
198	NC_015390	AAT	2	6	27840	27845	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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200	NC_015390	T	6	6	27884	27889	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
201	NC_015390	ATTA	2	8	27912	27919	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
202	NC_015390	TTA	2	6	28459	28464	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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204	NC_015390	T	6	6	28518	28523	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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235	NC_015390	ATT	2	6	32824	32829	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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288	NC_015390	TAT	2	6	36871	36876	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
289	NC_015390	TTA	2	6	36904	36909	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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292	NC_015390	A	6	6	37798	37803	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
293	NC_015390	T	7	7	37843	37849	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
294	NC_015390	AAAAT	2	10	37860	37869	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
295	NC_015390	A	7	7	37876	37882	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
296	NC_015390	TAAA	2	8	37932	37939	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
297	NC_015390	AT	4	8	37965	37972	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.